博士學院

聖大博士生院提供以研究博士學位課程，旨在培養學生在特定知識領域內的高級理論與實踐研究能力。 博士候選人需完成研究方法和所選研究領域基礎知識的必修課程（1年），隨後在指導教授指導下完成博士論文（2至4年）。

健康科學學院

藝術及人文學院

The Faculty of Arts and Humanities (FAH) offers a rich multi-cultural, and exciting environment for students who engage with the intersection of Arts, Humanities and Technology, addressing the great human challenges of our times. FAH offers degrees in four key areas of studies: Media Arts and Technology; Architecture and Design; History and Heritage; Languages and Culture.

商學及法律學院

商學院致力於研究私形、公共及非牟利機構的管理及領導。我們的目標是培育創新及以社會為導向的領導人才，準備迎接在澳門、珠三角及國際顆伴國家所面對的挑戰及商機。行政及領導學院自1997年開始發展，目前在世界五大洲均有我們的校友。

宗教研究及哲學學院

宗教研究及哲學學院提供基督宗教研究學士學位課程及宗教研究碩士和博士學位課程。

教育學院

教育學是聖若瑟大學最早開設的專業之一。經過多年耕耘，教育學院吸引了一大批對教育事業充滿熱情的學生、教師、研究人員和學界管理人才，形成了一個立足澳門、展望灣區和面向世界的學術社群。

數據工程與科學學院

數據科學與工程致力研發以數據為中心的解決方案、演算法和理論，應用於高精尖的工程、商業、醫療和科學數據分析，以解決工程、科學和社會問題。

科學及環境研究所

科學與環境研究所在不同科學領域開展研究，包括環境科學、生物學、地球科學等等。我們的研究與本中心所提供的課程息息相關，如環境科學與管理碩士學位及科學博士學位課程。此外，我們亦為聖若瑟大學其他學院的學士及碩士學位課程提供科學及數學科目。